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191
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diff --git a/molrep_check/em.bat b/molrep_check/em.bat
index 2f0f992..96ddd75 100755
--- a/molrep_check/em.bat
+++ b/molrep_check/em.bat
@@ -8,6 +8,8 @@ $MR_TEST/molrep -m ../em/model.pdb -f ../em/pel.map -po out/ -ps scr/ -i <<stop
# --------------------------------
_NMON 6
stop
+echo $?
+[[ $? ]] || exit 1
# --------------------------------
#
# 2. Atomic model --> EM map
@@ -20,6 +22,7 @@ $MR_TEST/molrep -m ../em/model.pdb -f ../em/pel.map -po out/ -ps scr/ -i <<stop
_NMON 6
_prf y
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# --------------------------------
#
# 3. Atomic model --> EM map
@@ -36,6 +39,7 @@ _ncs 322
_centre 0.500 0.490 0.490
_angles 0.0 0.0 90.0
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# --------------------------------
#
cp out/molrep.pdb hexamer.pdb
@@ -52,6 +56,7 @@ $MR_TEST/molrep -mx hexamer.pdb -f ../em/pel.map -po out/ -ps scr/ -i <<stop
# --------------------------------
_DOM s
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# --------------------------------
#
# 5. EM --> X-ray
@@ -60,6 +65,7 @@ stop
$MR_TEST/molrep -f ../em/p2.cif -m ../em/pel.map -po out/ -ps scr/ -i <<stop
# --------------------------------
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# --------------------------------
#
# 6. Placing the model to a particular orientation and position.
@@ -72,4 +78,5 @@ $MR_TEST/molrep -f ../em/p2.cif -m ../em/pel.map -po out/ -ps scr/ -i <<stop
_fun s
_file_t ../em/tab
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#==========================================
diff --git a/molrep_check/mr.bat b/molrep_check/mr.bat
index 284a4cd..6e00695 100755
--- a/molrep_check/mr.bat
+++ b/molrep_check/mr.bat
@@ -10,6 +10,7 @@
$MR_TEST/molrep -f ../data/test.mtz -m ../data/test_mod.pdb -po out/ -ps scr/ -i <<stop
# --------------------------------
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -26,6 +27,7 @@ _nmon 2
_COMPL .5
_SIM .7
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -46,6 +48,7 @@ $MR_TEST/molrep -f ../data/test.cif -m ../data/test_mod.pdb -mx ../data/test_mod
# --------------------------------
_NP 3
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -67,6 +70,7 @@ $MR_TEST/molrep -f ../data/test.cif -m ../data/test_mod.pdb -po out/ -ps scr/ -i
_NMON 2
_NP 3
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -85,6 +89,7 @@ _NPT 3
_NPTD 3
_DYAD D
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -103,6 +108,7 @@ _NP 3
_NPT 10
_NMR 3
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -118,6 +124,7 @@ _PRF Y
_compl 1.
_sim .2
stop
+[[ $? ]] || exit 1
#
# =================================================================
#
@@ -136,6 +143,7 @@ _ph PH
_fom FOM
#
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# =================================================================
#
# 9. use sequence
@@ -145,6 +153,7 @@ stop
$MR_TEST/molrep -f ../data/s100.mtz -m ../data/monomer.pdb -s ../data/s100.seq -po out/ -ps scr/ -i <<stop
# --------------------------------
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# =================================================================
#
# 10. Locked RF
@@ -157,6 +166,7 @@ _lock y
_file_tsrf ../data/srf.tab
_nsrf 1
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# =================================================================
#
# 11. Multi-monomer search using NCS, SELF = 'A' means to compute Self RF and
@@ -169,6 +179,7 @@ $MR_TEST/molrep -f ../data/s100.mtz -m ../data/monomer.pdb -m2 ../data/monomer.p
_self a
_nsrf 1
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# =================================================================
#
# 12. use pst
@@ -179,6 +190,7 @@ $MR_TEST/molrep -f ../data/pst.mtz -m ../data/model_pst.pdb -po out/ -ps scr/ -i
# --------------------------------
#
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# =================================================================
#
# 13. space group check
@@ -189,7 +201,8 @@ $MR_TEST/molrep -f ../data/test.mtz -m ../data/test_mod.pdb -po out/ -ps scr/ -i
# --------------------------------
_sg all
#
-stop
+s[[ $? ]] || exit 1
+top
# ==========================================================
#
# 14. Example for finding HA position by MR solution.
@@ -206,6 +219,7 @@ _SIGFD SIGFD3
#
_FUN d
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# ==========================================================
#
# 15. Example for HA search by multi-copy search
@@ -225,6 +239,7 @@ _diff h
_dyad y
_nmon 4
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# ==========================================================
#
# 16. Example HA for search by translation function
@@ -242,6 +257,7 @@ _FUN t
_diff h
_nmon 4
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# ==========================================================
#
# 17. Example for Self RF for Heavy Atom structure in derivative.
@@ -258,4 +274,5 @@ _SIGFD SIGFD3
_FUN r
_diff h
stop
+[[ $? ]] || exit 1
# ==========================================================
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