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diff -ur NAMD_2.8_Source.orig/Makefile NAMD_2.8_Source/Makefile
--- NAMD_2.8_Source.orig/Makefile 2011-07-30 13:17:02.513705293 -0500
+++ NAMD_2.8_Source/Makefile 2011-07-30 13:18:03.363943762 -0500
@@ -362,7 +362,7 @@
namd2: $(INCDIR) $(DSTDIR) $(OBJS) $(LIBS)
$(MAKEBUILDINFO)
- $(CHARMC) -verbose -ld++-option \
+ $(CHARMC) $(LDFLAGS) -verbose -ld++-option \
"$(COPTI)$(CHARMINC) $(COPTI)$(INCDIR) $(COPTI)$(SRCDIR) $(CXXOPTS)" \
-module NeighborLB -module HybridLB -module RefineLB -module GreedyLB -language charm++ \
$(BUILDINFO).o \
@@ -404,7 +404,7 @@
$(COPY) $(CHARM)/bin/charmd_faceless.exe charmd_faceless.exe
psfgen: $(DSTDIR) $(SBOBJS) $(PLUGINOBJS)
- $(CC) $(SBCFLAGS) -o psfgen $(SBOBJS) $(PLUGINOBJS) $(TCLLIB) $(TCLAPPLIB) -lm
+ $(CC) $(SBCFLAGS) $(LDFLAGS) -o psfgen $(SBOBJS) $(PLUGINOBJS) $(TCLLIB) $(TCLAPPLIB) -lm
psfgen.exe: $(DSTDIR) $(SBOBJS) $(PLUGINOBJS) $(TCLDLL)
$(CC) $(SBCFLAGS) -o psfgen $(SBOBJS) $(PLUGINOBJS) $(TCLLIB) $(TCLAPPLIB) -lm
@@ -413,17 +413,17 @@
$(CC) $(CFLAGS) -o diffbinpdb $(SRCDIR)/diffbinpdb.c -lm
flipdcd: $(SRCDIR)/flipdcd.c
- $(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(SRCDIR)/flipdcd.c || \
+ $(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) -o $@ $(SRCDIR)/flipdcd.c || \
echo "#!/bin/sh\necho unavailable on this platform" > $@; \
chmod +x $@
flipbinpdb: $(SRCDIR)/flipbinpdb.c
- $(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(SRCDIR)/flipbinpdb.c || \
+ $(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) -o $@ $(SRCDIR)/flipbinpdb.c || \
echo "#!/bin/sh\necho unavailable on this platform" > $@; \
chmod +x $@
fixdcd: $(SRCDIR)/fixdcd.c
- $(CC) $(CFLAGS) -o fixdcd $(SRCDIR)/fixdcd.c
+ $(CC) $(CFLAGS) $(LDFLAGS) -o fixdcd $(SRCDIR)/fixdcd.c
dumpdcd: $(SRCDIR)/dumpdcd.c
$(CC) $(CFLAGS) -o dumpdcd $(SRCDIR)/dumpdcd.c
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